Syncovery может копировать разрешения на доступ NTFS вместе с файлами.
На вкладке Специальное в настройках профиля, вы найдере галочку называемую «Безопасн. И Совместн. Доступ». При установке галочки появляется всплывающий диалог, на левой стороне нужно отметить три галочки (Копировать Настройки Владельца/Групповая/Разрешения).
Если у базовых папок источника и назначения еще нет таких же разрешений, нужно так же выбрать «Обработать также Базовую Папку». Эта функция применит разрешения базовой папки исходного источника к папке источника назначения, таким образом все под-папки и файлы могут наследовать разрешения оттуда. При необходимости(радиокнопка Файлы и Папки), Syncovery подавит наследование разрешений от базовой папки источника назначения и разрешения файлов и папок источника и назначения будут совпадать(точная копия разрешений). Наследование разшешений в источнике назначения не будет подавлено ни в каких под-папках, если оно не подавлено на стороне источника.
Кроме этого, программа должна быть запущена «Как Администратор». Для запуска под правами администратора, по правому клику на пиктограмме программы выберите
«Запустить Как Администратор», вышеописанное относится к Windows версий старше чем Vista, или на машине не запрещен UAC.
При использовании Планировщика, для использования функциональности копирования разрешений программу нужно запускать как службу. Смотрите
Установка Планировщика как Службу